Gouverneto ist eines der ältesten Klöster auf Kreta und geht auf das Jahr 1537 zurück. Das Kloster hat die Form einer Festung mit Türmen an jeder Ecke. Starke venezianische Einflüsse sind überall sichtbar.

Die Hauptkirche von Gouverneto ist der Erscheinung der Jungfrau Maria geweiht. Die Kirche hat eine gewölbte Decke und Wehrtürme an jeder Ecke. Feines venezianisches Schnitzwerk schmückt die Fassade. Der Schutzheilige der kleineren Kapelle ist St. Johannes der Eremit, der Gründer des Klosters.

Während des griechischen Aufstands im Jahre 1821 plünderten die Türken das Kloster. Viele Mönche kamen ums Leben, und die Archive des Klosters wurden zerstört. Später, im zweiten Weltkrieg mußte Gouverneto, zusammen mit der Bevölkerung, aufs neue leiden, als die Deutschen hier ein Wachtquartier einrichteten. Wieder begingen Eindringlinge Plünderungen und verursachten dem Kloster schwere Schäden.