Η Κρήτη είναι η φυσική και φιλόξενη κατοικία μιας πλούσιας και πολυποίκιλης χλωρίδας. Ανάμεσα σε πλήθος φυτών υπάρχουν και 130 διαφορετικά είδη αγριολούλουδων και βοτάνων που φυτρώνουν μόνο στην Κρήτη. Σ΄ αυτά συγκαταλέγεται το δίκταμο (Organium Dictamus), βότανο, γνωστό ήδη από τον Αριστοτέλη για τις θεραπευτικές του ιδιότητες. Ένα άλλο μοναδικό στοιχείο της χλωρίδας είναι και μία ξεχωριστή ποικιλία πλάτανου (varietus cretica), ο οποίος παραμένει πράσινος και διατηρεί το φύλλωμά του ολόκληρο το χρόνο.

Η Κρητική άνοιξη είναι σίγουρα η καλύτερη περίοδος για να θαυμάσει κάποιος τη χλωρίδα του νησιού, τότε που η φύση αναγεννιέται ύστερα από τις σφοδρές βροχοπτώσεις του χειμώνα. Τα χωράφια μοιάζουν να φλέγονται από τις κόκκινες παπαρούνες και ο αέρας μοσχοβολά από το άρωμα των πορτοκαλανθών και των λεμονανθών. Το καλοκαίρι η επιφάνεια του εδάφους καλύπτεται από ξερά θαμνόδεντρα, ενώ οι ρεματιές γεμίζουν από ανθισμένες ροδοδάφνες και λυγαριές. Κατά τη διάρκεια του χειμώνα οι μελαγχολικές ανεμώνες είναι άφθονες στην Κρητική φύση.

Τα πιο σπάνια φυτά της Κρήτης ευδοκιμούν στις ρεματιές και τις απόκρημνες βουνοπλαγιές, όπως στο φαράγγι της Ίμπρου, κοντά στο καταφύγιο Καλλέργη, και στο Οροπέδιο Σπηλίου. Τέτοια φυτά είναι τα Εbenous cretica, Linum arboreum, Campanula pelviformis, stachelina arborea και petromarcula arboreum. Στις πεδιάδες και τις ψηλές κορυφές ευδοκιμούν άλλα φυτά όπως τα tulipa bakeri, tulipa saxalatis, anchusa caespitosa, scabiosa alborinca και scabiosa minoana. Η ποικιλία φοίνικα που ευδοκιμεί στη Κρήτη (Phoenix Theophrasti) είναι μοναδική στον κόσμο και αναπτύσσεται κατά μήκος της παραλίας του Βάι. Άλλα σπάνια είδη φυτών συναντώνται κατά μήκος των ακτών, όπως τα pancratium maritime, centaurea pumilio, anthemistomentell και Anthemis filicaulis (χαμομήλι).