Itanos war ehemals eine bedeutende Siedlung von der minoischen Zeit bis in die Jahre des Christentums. Den Höhepunkt seiner Macht erreichte es in der griechischen Zeit bis zum siebten Jahrhundert v. Chr. Itanos lag in ständigem Krieg mit Ierapytna. Ein wichtiger Grund dieser Streitereien war die Auseinandersetzung um die Kontrolle des Zeus-tempels von Palaikastro. Wie die Inschrift im Toplou-Kloster zeigt, wandten sich die beiden Städte im Jahre 132 v. Chr. ans Schiedsgericht von Magnesia in Kleinasien, um ihren Zwist beizulegen.