Το σύγχρονο κτίριο της Καθολικής εκκλησίας (1890) βρίσκεται στη συμβολή των οδών Μεσολογγίου και Σαλαμίνας (Λειτουργία: 10:00 Κυριακή). Η εκκλησία αυτή χτίστηκε προκειμένου να εξυπηρετήσει τον μικρό Καθολικό πληθυσμό του Ρεθύμνου, και τώρα απευθύνεται στους καλοκαιρινούς επισκέπτες. Το κτίριο έχει μια ενδιαφέρουσα πρόσοψη με ένα μεγάλο παράθυρο πάνω από την είσοδο.