Το χωριό Ζωνιανά βρίσκεται 47 χιλιόμετρα νοτιοανατολικά του Ρεθύμνου στο δρόμο Ρέθυμνο - Πάνορμος - Πέραμα - Μουρτζανά - Αξός.

Η σπηλιά Σεντόνι βρίσκεται κοντά στα Ζωνιανά.