Η Σπηλιά του Σκοτεινού είναι μια απ' τις πιο σημαντικές ιερές σπηλιές στην Κρήτη και μια απ' τις πιο βαθιές. Έχει βάθος 160 μέτρα και τέσσερα επίπεδα. Εξερευνήθηκε πρώτα από τον Evans και το 1962 ο αρχαιολόγος Κ. Δαβαράς πραγματοποίησε συστηματικές ανασκαφές. Ανακάλυψε κομμάτια από βάζα, κοκάλινες βελόνες και υστερομινωϊκές μπρούντζινες φιγούρες που χρονολογούνται από τους Νεολιθικούς μέχρι τους Ρωμαϊκούς Χρόνους. Όπως πολλές άλλες σπηλιές φαίνεται ότι είχε κάποια θρησκευτική σημασία. Μερικοί πιστεύουν ότι ήταν ο λαβύρινθος του μυθικού Μινώταυρου.