Η ακρόπολη της Γόρτυνας βρίσκεται στη δυτική πλευρά του ποταμού βόρεια από τον κεντρικό δρόμο, στην κορυφή του λόφου. Η επίσκεψη αξίζει και μόνο για τη θέα της Πεδιάδας της Μεσαράς αλλά και την πανοραμική εικόνα των περιφραγμένων περιοχών του Αγίου Τίτου και του Ωδείου από κάτω που θα σας προσφέρει. Το μονοπάτι ξεκινά από δεξιά του ποταμού και ανηφορίζει στο λόφο αμέσως μετά το θέατρο που βρίσκεται απέναντι. Η ανάβαση διαρκεί περίπου 15 λεπτά και σας οδηγεί στην κορυφή. Εκεί φαίνονται τα ερείπια του υδραγωγείου, που έφερνε νερό από τις πηγές στο νότιο τμήμα του Ψηλορείτη. Στην ακρόπολη υπάρχουν ερείπια ενός ρωμαϊκού τοίχου που φτάνει τα έξι μέτρα ύψος (ονομάζεται Κάστρο) και ο ναός της Αθηνάς του 7ου π.Χ. αιώνα. Ο ναός μετατράπηκε σε βασιλική τον 6ο αιώνα μ.Χ.