Kommos est situé à 71km au sud-ouest d'Iraklion, au bord de la mer, juste au nord de Matala.

En quittant Matala, vous tournez à un virage, après les terrains de campement sur la colline. Avant le village de Pitsidia, vous tournez à gauche, vers la région de Kommos. Il y a des pistes et vous arrivez à Kommos, après 15 minutes de marche, ou vous descendez en voiture de la route principale.