A Patsos se trouvent, aussi, les ruines de l'église Byzantine de la Panagia, qui contient des fresques. L'église de la Panagia, selon Gerola (un photographe historique Italien qui visita la Crète en 1902) avait neuf dômes (!) et les cinq du milieu, étaient plus larges que les autres. Les gens de la région parlent aussi d'une église de la Panagia qui avait 101 fenêtres et portes. Le toit de l'église s'est écroulé, mais certains murs de l'église et quelques fresques ont résisté. L'environnement ressemble à celui d'un ancien temple. Un court sentier qui part du centre du village, mène à l'église. Aucune excavation systématique n'a été faite.