Η Αγία Τριάδα βρίσκεται 64 χιλιόμετρα νοτιοδυτικά του Ηρακλείου, στη διαδρομή Ηράκλειο - Αγία Βαρβάρα - Άγιοι Δέκα - Μοίρες - Φαιστός - Αγία Τριάδα. Είναι πολύ κοντά στη Φαιστό.

Κατά τη διάρκεια της Μινωικής Εποχής ένας δρόμος ξεκινούσε από τη Φαιστό και κατέληγε στη βασιλική έπαυλη της Αγίας Τριάδας. Αυτή η έπαυλη, ίσως ήταν η καλοκαιρινή κατοικία των βασιλιάδων της Φαιστού, αν και αυτό παραμένει μυστήριο.