Το χωριό Έμπαρος βρίσκεται 51 χιλιόμετρα νοτιοανατολικά του Ηρακλείου, στο δρόμο προς Άνω Βιάννο.

Η Έμπαρος ήταν το μεγαλύτερο χωριό της Πεδιάδας κατά τη Βενετοκρατία, γεγονός που αποδεικνύεται από τις πολλές βυζαντινές εκκλησίες που υπάρχουν στην περιοχή.