Das sogenannte Archiv befindet sich in den Privatgemächern nördlich der Empfangsräume und erhielt seinen Namen wegen der großen Truhe, die über 200 Tonsiegel - vermutlich zum Versiegeln von Dokumenten - enthalten hatte. Die Fresken, die einst die Wände der inneren Kammer geschmückt hatten, sind jetzt im Museum von Iraklion ausgestellt.