Mikri Episkopi de Milopotamos se trouve à 34 km à l'est de Rethimnon, entre le Psiloritis et les montagnes de Kouloukonas. Route Rethimnon - Panormon - Perama - Mourtzana, tournant au sud, juste avant Mourtzana.

A Episkopi se trouvent les ruines impressionnantes de l'Evêché de Milopotamos.