La Corte Centrale, orientata a nordest-sudovest, è un poco diversa da quella degli altri palazzi cretesi, oltre ad essere anche di dimensioni molto più modeste. L'accesso alla corte è posto fra i due pilastri difronte al bacino lustrale. Nella parte nord-occidentale della corte si trova un grande blocco rastremato, che si ritiene sia stato un altare. All'angolo sud-est della corte si trova un pozzo, nel quale è stato rinvenuto un contenitore con olive in salamoia, perfettamente conservate dopo ben 3000 anni! Questo pozzo fornisce ancor oggi acqua potabile.